40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4643 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 
245 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  47.9 
 
 
252 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  42.11 
 
 
246 aa  161  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  41.81 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.92 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  36.63 
 
 
247 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  40.31 
 
 
141 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  33.9 
 
 
307 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  29.24 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.76 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  31.43 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2255  hypothetical protein  25.59 
 
 
671 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00144777  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  30.14 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  30.14 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  33.63 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  28.91 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  32.22 
 
 
307 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
320 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  33.06 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  35.19 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  30.11 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  32.29 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  34.58 
 
 
270 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  22.73 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1901  protein of unknown function DUF81  26.03 
 
 
247 aa  45.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.407274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  26.62 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.68 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.65 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  35.56 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  23.23 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.82 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  29.32 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.23 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  24.48 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  35.8 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>