23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0807 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  41.04 
 
 
245 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  43.91 
 
 
246 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  47.9 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.48 
 
 
245 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  40.61 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  33.06 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  37.02 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  38.42 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  36.03 
 
 
141 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  32.77 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  24.25 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  27.52 
 
 
343 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.02 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26.27 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.72 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  22.95 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2787  hypothetical protein  26.98 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.369354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0509  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  26.29 
 
 
257 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>