38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1500 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 249 aa  470  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  60.49 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  57.71 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  43.86 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  37.76 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  49.23 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  35.02 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  31.71 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  33.89 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  31.07 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  28.76 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.84 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  28.67 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.27 
 
 		 2798 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.35 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  31.11 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  34.4 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  28.1 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  28.89 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.89 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.89 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  30.56 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.85 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  33.68 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>