33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2150 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 245 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  92.04 
 
 		 245 aa  355  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  68.57 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  42.74 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  43.75 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  42.55 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  42.55 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  46.15 
 
 		 141 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.58 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  26.63 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.9 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.7 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  27.05 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  26.57 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  30.18 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  33.04 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.87 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  28.98 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.79 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.85 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.8 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  25.7 
 
 		 263 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>