24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3166 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  594  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  76.11 
 
 		 247 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  57.71 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  40.59 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  43.42 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.54 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  34.87 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  37.02 
 
 		 252 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  33.9 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  41.35 
 
 		 141 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.49 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.61 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.1 
 
 		 2798 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  34.91 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  27.36 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.25 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.89 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  27.32 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.17 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>