19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1646 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  100 
 
 		 247 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  76.11 
 
 		 307 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  60.25 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  42.61 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  34.89 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  36.63 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  33.06 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 141 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  32.24 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.65 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  33.85 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.94 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  27.92 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.96 
 
 		 291 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  31 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  29.77 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>