51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2830 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  70.35 
 
 
245 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  71.24 
 
 
245 aa  262  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  46.78 
 
 
246 aa  185  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  41.7 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  42.4 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  40.59 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 
249 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  49.63 
 
 
141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  34.03 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  30.85 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.7 
 
 
291 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2182  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000194994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  27.36 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.32 
 
 
270 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.47 
 
 
269 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.56 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.9 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.56 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.56 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.85 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  31.29 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  23.58 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  26.83 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.68 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  25.24 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.3 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.3 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  33.81 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  36.19 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  35 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  35 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  24.29 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  26.92 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  29.52 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.64 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.79 
 
 
343 aa  42.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  33.81 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.64 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.22 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  26.95 
 
 
139 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  26.82 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.95 
 
 
262 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.95 
 
 
262 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  24.6 
 
 
257 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.95 
 
 
266 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>