27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2071 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
245 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  92.04 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  67.76 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  43.04 
 
 
246 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  42.98 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  40.43 
 
 
252 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  43.1 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  41.6 
 
 
248 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 
249 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  46.56 
 
 
141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  35.44 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  32.37 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.81 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  28.5 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  31.58 
 
 
301 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.7 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.7 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.64 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.72 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.58 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.41 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  28.17 
 
 
139 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.17 
 
 
266 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>