More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2084 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  86.05 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  67.41 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  58.7 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  58.7 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  58.7 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  63.23 
 
 		 291 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  65.04 
 
 		 291 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  65.04 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  66.26 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  61.4 
 
 		 257 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  61.51 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  47.35 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  51.53 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  63.98 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  59.59 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  48.46 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  40.16 
 
 		 250 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  41.41 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  53.3 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  40.09 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  40.87 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  36.71 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  34.62 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  41.15 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  40.85 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  39 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.61 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  34.33 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  41.84 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  41.23 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.18 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  46.26 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  38.26 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30.86 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  43.5 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  37.3 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  37.55 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.4 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  44.77 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.4 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  37.12 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  37.12 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  37.12 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  37.12 
 
 		 256 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36.73 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  39.9 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  35.34 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.88 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  37.55 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  28.94 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  34.06 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  37.18 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  35.93 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  34.43 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  37.18 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  38.07 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.09 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.97 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.31 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  29.5 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.34 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  35.11 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.8 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  45.05 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  32.57 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  29.72 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33.73 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  30.32 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.81 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  32.18 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.65 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  38.14 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  39.82 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  41.77 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  29.86 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.55 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  30.84 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  37.29 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  37.29 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.15 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  38.36 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  32.03 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  39.51 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.22 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  32.24 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  33.6 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  36.21 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  36.41 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>