215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3591 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  75 
 
 
272 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  71.33 
 
 
331 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  64.66 
 
 
273 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  64.29 
 
 
273 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  62.45 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  54.58 
 
 
276 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  58.94 
 
 
285 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  49.25 
 
 
269 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  56.03 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  55.64 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  59.27 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  48.51 
 
 
272 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  60.08 
 
 
272 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  59.35 
 
 
272 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  52.57 
 
 
268 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  51.15 
 
 
266 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  49.6 
 
 
254 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  48.62 
 
 
264 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  44.71 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  48.29 
 
 
268 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  46.24 
 
 
267 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  47.15 
 
 
268 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  46.21 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  46.21 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  46.95 
 
 
268 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  46.56 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  48.61 
 
 
268 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  46.18 
 
 
268 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  48.21 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  48.21 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  47.1 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  43.44 
 
 
268 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  37.75 
 
 
290 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  39.11 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.22 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  31.77 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.65 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.05 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.49 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  34.73 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.48 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.71 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.99 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30 
 
 
2798 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.96 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.96 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.69 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.64 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  25.51 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  31.51 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 
255 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.17 
 
 
255 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.22 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  29.08 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  31.4 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  32.51 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  29.08 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  31.82 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.7 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  32.24 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  27.49 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.84 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  29.94 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  27.14 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  33.77 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  33.77 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  27.14 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  33.77 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.58 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  31.58 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  29.55 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  22.47 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  32.41 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.51 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  29.03 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  34.19 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>