More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0368 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 267 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  85.27 
 
 		 272 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  83.15 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  61.64 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  55.82 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  64.07 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  56.2 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  61.89 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  61.6 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  54.88 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  60.75 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  49.15 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  54.07 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  49.42 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  52.92 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  59.29 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  52.21 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  48.43 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  47.1 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  47.1 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  44.92 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  49.22 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  53.48 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  38.41 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  46.32 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.75 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  43.48 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  43.48 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.2 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  38.33 
 
 		 299 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  41.33 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  32.62 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.07 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  39.78 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.02 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  38.07 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.61 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.96 
 
 		 2798 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.94 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  31.3 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.35 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.53 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  40.61 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.34 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  30.59 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.8 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.84 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.51 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  31.97 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.23 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.75 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.4 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  25.56 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.07 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30.57 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.03 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  32.62 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.06 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.81 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  29.74 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32.16 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.9 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.08 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.1 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.2 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.04 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  31.74 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  45.74 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.02 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  34.05 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.56 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  27.59 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.14 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.9 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  38.02 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>