274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1999 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  497  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  60.71 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  97.22 
 
 
226 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  58.9 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  60.34 
 
 
262 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  57.79 
 
 
286 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  52.17 
 
 
271 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  48.22 
 
 
260 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  53.79 
 
 
260 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  57.54 
 
 
261 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  51.93 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  53.79 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  47.47 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  45.14 
 
 
272 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  48.52 
 
 
267 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  45.53 
 
 
267 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  52.21 
 
 
261 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  52.11 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  48.63 
 
 
261 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  48.63 
 
 
261 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  47.1 
 
 
266 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  48.05 
 
 
257 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  43.08 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  39.47 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  50.21 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  41.54 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  54.18 
 
 
261 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  45.42 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  46.84 
 
 
268 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  43.51 
 
 
268 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  43.88 
 
 
268 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  43.32 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  44.07 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  45.88 
 
 
255 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.73 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.04 
 
 
301 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  38.46 
 
 
256 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  38.46 
 
 
256 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.92 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.92 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.92 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  31.62 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  36.97 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  34.87 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  31.42 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.3 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.55 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.38 
 
 
2798 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.31 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.96 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.43 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.12 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  29.49 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.77 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.34 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.98 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.54 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.74 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.97 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.55 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.07 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.38 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.64 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30.04 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  27.8 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.94 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.77 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.41 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.22 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.97 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  29.17 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.22 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.37 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.97 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.42 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.94 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  26.54 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.34 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.5 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  26.92 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>