More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1919 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  63.25 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  63.37 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  59.75 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  59.61 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  58.47 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  52.14 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  58.27 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  55.29 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  48.82 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  51.52 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  48.65 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  51.94 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  48.82 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  50.99 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  50.99 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  49.6 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  49.24 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  50.2 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  45.61 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  46.86 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  42.54 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  50.97 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  45.85 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  49.57 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  49.37 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  48.05 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  46.47 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.37 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  47.64 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  46.03 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  42.96 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  60.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42.29 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.72 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.6 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  39.22 
 
 		 301 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.33 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  33.6 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.2 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.2 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.2 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.54 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.65 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.82 
 
 		 2798 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.48 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  33.48 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.16 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  31.58 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  36.72 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.12 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  34.2 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.66 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.85 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.24 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  31.11 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.27 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.21 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  34 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  28.71 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  34.65 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.86 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.59 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.96 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  31.5 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  33.95 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  30.19 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  32.05 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  26.07 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30.89 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  33.02 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  30.3 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.53 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.09 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.54 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.92 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.53 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.6 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  31.15 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  25.81 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>