More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2893 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  72.93 
 
 
267 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  74.43 
 
 
269 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  61.92 
 
 
267 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  62.93 
 
 
267 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  62.17 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  74.52 
 
 
268 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  73.76 
 
 
268 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  58.33 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  56.42 
 
 
271 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  56.17 
 
 
262 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  54.89 
 
 
259 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  53.85 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  54.98 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  57.81 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  52.55 
 
 
260 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
260 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  57.36 
 
 
259 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  53.74 
 
 
257 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  56.37 
 
 
261 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  52.51 
 
 
261 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  50.97 
 
 
253 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 
261 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  47.58 
 
 
261 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  48.25 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  46.84 
 
 
261 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  41.84 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  48.72 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  39 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.81 
 
 
267 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  40.31 
 
 
293 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  49.51 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  49.51 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.92 
 
 
299 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  38.3 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  44.72 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  39.44 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  37.6 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  38.03 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.32 
 
 
2798 aa  92.4  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  37.56 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  37.96 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.8 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.56 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.56 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  33.51 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.15 
 
 
254 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.62 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  39.78 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.62 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  33.7 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.67 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  33.7 
 
 
270 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.17 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 
303 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.44 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  33.89 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  36.06 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  33.79 
 
 
302 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  33.2 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.86 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.8 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.82 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.33 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  34.56 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  32.27 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  31 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.94 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  36 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  29.65 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.65 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  29.34 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  32.81 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.74 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  25.31 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.96 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.34 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.89 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.04 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.47 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.89 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.74 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.32 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.12 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  34.36 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  34.36 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  37.2 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.72 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  27.1 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30.23 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>