More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1573 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  73.81 
 
 		 260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  63.25 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  63.35 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  61.04 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  63.39 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  57.2 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  55.21 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  55.02 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  59.77 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  55.93 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  52.57 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  57.69 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  52.96 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  57.54 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  48.81 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  48.81 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  50.41 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  46.54 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  52.23 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  51.88 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  52.12 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  56.33 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  49.4 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  43.3 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  54.27 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  50.42 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  46.98 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  49.75 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  49.75 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  44.56 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  58.04 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  44.44 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 		 291 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  37.66 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.55 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.55 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  39.72 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.19 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  36.19 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.69 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  41.9 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.37 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.22 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.06 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  33.49 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29 
 
 		 2798 aa  79.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.14 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  33.86 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.82 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.82 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.35 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  28.99 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.83 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  29.66 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.84 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.69 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  29.3 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  32.42 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  38.83 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  33.74 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.49 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  29.3 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.36 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.74 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  29.67 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  32.53 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  33.9 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  32.35 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  40.22 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  29.58 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.95 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.77 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.48 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  32.82 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.4 
 
 		 296 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32.81 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  29.82 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>