252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4664 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  52.57 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  52.65 
 
 
262 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  53.36 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  49.8 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  50.59 
 
 
260 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  51.76 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  50.75 
 
 
267 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  49.14 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  49.28 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  49.41 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  48.18 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  49.25 
 
 
267 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  50.6 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  51.24 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  44.72 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  41.44 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  45.06 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  50.97 
 
 
268 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  49.78 
 
 
269 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  43.43 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  49.26 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  47.91 
 
 
262 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  50.22 
 
 
268 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  42.98 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  38.15 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  51.1 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  40.52 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  35.61 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 
293 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.98 
 
 
299 aa  88.6  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  44.44 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.44 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  38.21 
 
 
291 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  37.44 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  41.41 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  32.42 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.64 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.37 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.37 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  36.99 
 
 
288 aa  72  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.39 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  35.75 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  34.33 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  32.35 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  32.26 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.77 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  37.57 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  34.32 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  29.29 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.91 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  35.53 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  34.76 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.65 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  37.86 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  26.84 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  30.84 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  30.74 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  25.7 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  31.98 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  31.98 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  32.47 
 
 
300 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  25.12 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  31.95 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.68 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  37.68 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  25.12 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.29 
 
 
2798 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.47 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.3 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.3 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.96 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  31.06 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  30.67 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  30.86 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.8 
 
 
306 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  25.12 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  25.17 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  41.95 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.36 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3462  hypothetical protein  26.9 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.85 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  33.47 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.6 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.8 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  37.63 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.29 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>