More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0129 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  487  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  91.76 
 
 		 269 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  92.91 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  69.5 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  61.51 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  74.52 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  61.75 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  60.15 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  56.47 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  57.48 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  57.6 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  56.52 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  58.4 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  54.27 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  54.18 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  52.55 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  58 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  57.44 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  56.49 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  52.73 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  58.16 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  46.49 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  46.49 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  49.17 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  51.35 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  49.2 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  42.62 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  47.9 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  36.89 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.15 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  35.38 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  39.64 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.81 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  44.81 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  38.86 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  38.49 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  38.49 
 
 		 291 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  39.3 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  39.3 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  39.3 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  40.88 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.86 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  38.73 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  43.56 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  38.24 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  37.6 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  35.23 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.32 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  32.13 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  34.2 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  39.17 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  32.87 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.33 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.54 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.69 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.84 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  33.71 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  30.8 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.06 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.45 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.28 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.83 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.83 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.94 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.94 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.45 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.75 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.51 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.66 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.66 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.56 
 
 		 2798 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.51 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.28 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  31.37 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.11 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.2 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.17 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.94 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.56 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.02 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  29.28 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  23.58 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.85 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  32.31 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.58 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.1 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.38 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  28.83 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  35.16 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30.43 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>