More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1101 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  67.58 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  59.3 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  60.38 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  58.37 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  55.16 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  53.45 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  53.06 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  54.03 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  52.17 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  52.17 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  59.52 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  52.21 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  55.51 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  54.12 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  52.33 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  56.6 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  48.92 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  50.83 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  55.94 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  51.94 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  49.8 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  52.99 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  53.63 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  51.79 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  42.8 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  54.51 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  53.71 
 
 		 268 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  35.43 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  37.83 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  45.69 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  45.69 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  39.29 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  40.61 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  34.67 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  36.82 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.78 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30.23 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.06 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.72 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  37.08 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.74 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.04 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  34.54 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.31 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  32.67 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.47 
 
 		 2798 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  32.84 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.15 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31.73 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.83 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.07 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.72 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  57.41 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.37 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.13 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  30.48 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  39.91 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  37.23 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.53 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.25 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.82 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.13 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  36.45 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.25 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  33.05 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.17 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  35.75 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  30.6 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.88 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  26.84 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  27.39 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  22.54 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  32.68 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  22.54 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  30.73 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.53 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  32.09 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>