More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2533 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  62.02 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  66.8 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  59.04 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  63.28 
 
 
262 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  59.52 
 
 
261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  54.88 
 
 
267 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  56 
 
 
260 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  54.88 
 
 
272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  53.71 
 
 
259 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  51.78 
 
 
260 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  55.17 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  53.66 
 
 
267 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  55.6 
 
 
260 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  56.86 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  55.98 
 
 
269 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  47.74 
 
 
257 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  56 
 
 
259 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  50.97 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  53.88 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  56.41 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  51.45 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  56.5 
 
 
268 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  51.5 
 
 
261 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  51.22 
 
 
261 aa  158  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  51.22 
 
 
261 aa  158  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  44.05 
 
 
260 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  51.18 
 
 
266 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  41.76 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  40.29 
 
 
276 aa  135  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  39.05 
 
 
267 aa  121  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  42.03 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  42.03 
 
 
256 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.97 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  40.44 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.66 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  38.03 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.35 
 
 
254 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  34.15 
 
 
254 aa  92  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  40.29 
 
 
255 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.36 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.36 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.36 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.87 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  35.05 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  35.75 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.38 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.38 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  33.83 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38.08 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.71 
 
 
2798 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.94 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  53.66 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.68 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  32.98 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.63 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.48 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  35.18 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.2 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.15 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  32.58 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.76 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  29.51 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.99 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.05 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.66 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  38.83 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.78 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.43 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.02 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  25.52 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  29.7 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  29.3 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  27.66 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  32.47 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.9 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  28.94 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.25 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.33 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.81 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.91 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.74 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.71 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.94 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  31.73 
 
 
343 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>