247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2015 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  96.34 
 
 		 273 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  81.25 
 
 		 273 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  62.41 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  64.04 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  64.29 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  55.06 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  52.04 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  56.39 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  56.4 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  53.53 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  55.82 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  52.59 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  56.8 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  57.2 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  56.22 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  55.02 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  48.62 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  46.07 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  48.62 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  46.07 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  46.07 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  48.22 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  46.04 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  45.28 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  45.49 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  45.49 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  42.47 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.47 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  45.11 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  45.17 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  43.61 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  41.27 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  36.32 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  34.57 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.38 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.92 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.02 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.02 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.47 
 
 		 2798 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  34.42 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.8 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.8 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.25 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.8 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.46 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.8 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  34.27 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.93 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  23.44 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  27.44 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.17 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.68 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.68 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.06 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.87 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  29.12 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  32.39 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.63 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.63 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.48 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  29.24 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  29.34 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  29.22 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.01 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.83 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  41.53 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.8 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  37.05 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  31.56 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  28.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.36 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.33 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.84 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>