198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3457 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  46.97 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  47.22 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  51.15 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  48.15 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  48.15 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  47.76 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  47.76 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  47.76 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  47.39 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  49.26 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  47.17 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  47.17 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  46.59 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  46.47 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  45.32 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  47.41 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  46.8 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  46.54 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  45.49 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  44.66 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  45.17 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  45.28 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  45.42 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  47.62 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  42.63 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  47.62 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  47.41 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  39.76 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  38.2 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  42.72 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  40.74 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  38.34 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.1 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.31 
 
 		 2798 aa  82.8  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.06 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.06 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  33.2 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  25.78 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.37 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.14 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.87 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.09 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.95 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  31.54 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  38.36 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.64 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  31.77 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  25 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  24.59 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  33.89 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  27.83 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.47 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.24 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.19 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  27.17 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  27.35 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  24.41 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  30.52 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 281 aa  62  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  23.02 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  23.02 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  26.85 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  25.77 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.84 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.16 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  28.9 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.45 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  27.14 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  31.4 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  25.71 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.09 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  23.39 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  23.39 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.43 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.15 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.21 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>