214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2250 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  56.2 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  52.47 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  53.96 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  54.44 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  51.71 
 
 		 273 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  53.75 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  51.13 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  43.23 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  47.79 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  47.71 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  54.33 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  46.92 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  52.42 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  54.15 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  47.79 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  47.79 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  47.39 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  45.83 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  46.59 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  45.45 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  45.45 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  45.45 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  45.45 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  46.39 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  43.46 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  45.77 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  49.18 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  43.14 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  42.64 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.22 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  41.98 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  37.99 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.79 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  33.72 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  33.72 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  33.76 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.42 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.11 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.88 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  39.75 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  39.75 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.47 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.33 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.8 
 
 		 2798 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  23.2 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  38.64 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  28.24 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.77 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  29.69 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25.97 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  28.26 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.79 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.52 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.52 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.8 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  30.24 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  31.08 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  28.17 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.33 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  22.76 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.71 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  23.26 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  34.01 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.74 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.74 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  29.18 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.86 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.86 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  31.91 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  29.22 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  34.67 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.39 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  38.18 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  32.13 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  24.2 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  27.56 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  30.11 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.22 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  24.63 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>