211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6243 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  75 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  69.01 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  64.04 
 
 		 273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  64.23 
 
 		 273 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  59.92 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  53.91 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  54.51 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  46.82 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  48.89 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  52.51 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  53.15 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  53.79 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  51.43 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  53.76 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  53.1 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  49.21 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  48.52 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  46.67 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  42 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  46.32 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  46.15 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  49.8 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  49.8 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  46.49 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  46.49 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  46.49 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  47.21 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  45.28 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  46.64 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  45.02 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  42.44 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  41.67 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  32.25 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.74 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.74 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.58 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.81 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  40.79 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  38.31 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  32.59 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.71 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.71 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  23.64 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  29.52 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  27.75 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  27.75 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  27.75 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  25.3 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  23.42 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.66 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.29 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.73 
 
 		 2798 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.91 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  28.1 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  27.1 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  25.74 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  30.99 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  27.23 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  39.5 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  29.76 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  28.63 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  28.41 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  38.24 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  38.24 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  27.08 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  29.39 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  24.59 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.22 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  24.22 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  27.87 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  27.74 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  25.44 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.71 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>