227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1541 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  81.25 
 
 		 273 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  80.15 
 
 		 273 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  60 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  62.45 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  59.92 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  51.87 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  53.36 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  55.94 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  56.4 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  51.92 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  55.82 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  54.44 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  54.8 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  56.4 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  56.22 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  54.22 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  48.69 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  48.69 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  48.87 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  49.25 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  49.62 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  50.4 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  50.2 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  50.2 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  48.5 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  47.89 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  47.89 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  44.67 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  45.42 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.47 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  45.08 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  44.3 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  38.42 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  25.21 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  30.33 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  27.64 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.28 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.28 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  33.84 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.93 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  29.93 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  35.1 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.47 
 
 		 2798 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.95 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32.13 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.15 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  31.73 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.26 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.58 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  35.11 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.81 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.8 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  30.9 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.21 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  32.97 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  38.05 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.17 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.27 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  29.12 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  35.55 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.02 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.66 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  28.71 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  26.36 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  33.19 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.83 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  31.31 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  30.46 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>