166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2294 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  34.56 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.69 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.82 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  34.66 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  34.47 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.48 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  32.14 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  33.58 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  31.95 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  31.77 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  32.83 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  32.25 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.37 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  32.32 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  32.37 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  34.47 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.89 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  35.4 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  27.06 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.43 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  27.39 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  27.39 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26.9 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.31 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  32.74 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.36 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  31.05 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  31.05 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  30.65 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  30.69 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  31.05 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  28.09 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  32.29 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  32.29 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  28.44 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  30.27 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  26.77 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.66 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  27.87 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  30.66 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.47 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  31.34 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  25.34 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.49 
 
 		 2798 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  30.66 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  25.29 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  30.47 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.35 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.44 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  24.31 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  24.31 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.81 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.87 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  29.52 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  26.88 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.58 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  23.58 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  25.59 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  25.87 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  23.79 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  48 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.44 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.44 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  27.63 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.13 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.43 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.17 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.13 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.13 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.13 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  24.2 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.13 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.13 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>