206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0355 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  75.98 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  62.55 
 
 
269 aa  299  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  55.06 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  53.18 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  53.36 
 
 
273 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  53.12 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  51.5 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  48.89 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  48.16 
 
 
273 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  49.4 
 
 
285 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  48.24 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  48.26 
 
 
272 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  47.41 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  49.21 
 
 
272 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  47.86 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  44.49 
 
 
276 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  42.16 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  42.16 
 
 
268 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  42.16 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  43.28 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  41.79 
 
 
268 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  41.79 
 
 
268 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  44.71 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  44.71 
 
 
268 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  41.79 
 
 
268 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  44.49 
 
 
267 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  43.95 
 
 
264 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  42.01 
 
 
268 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  39.26 
 
 
267 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  37.07 
 
 
268 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  36.9 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  38.29 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  36.65 
 
 
268 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 
290 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  31.7 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  30.8 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  30.6 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  29.93 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.93 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.73 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.89 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.11 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.71 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.44 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.61 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  27.45 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.79 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.31 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.37 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.04 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.79 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.61 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.36 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25.39 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  27.95 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  30.83 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.44 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.67 
 
 
306 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.9 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  28.28 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  23.22 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.48 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  26.12 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.52 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.3 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  27.43 
 
 
301 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.36 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.31 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  24.11 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  25.66 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.25 
 
 
2798 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.04 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  22.42 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  24.71 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.12 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  25.66 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  28.96 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
257 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.24 
 
 
330 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  29.67 
 
 
291 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  31.7 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  28.81 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 
312 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  26.72 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  22.49 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>