235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0602 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  78.18 
 
 		 308 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  79.02 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  79.34 
 
 		 307 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  66.45 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  67 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  67.33 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  66.56 
 
 		 306 aa  361  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  61.92 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  58.63 
 
 		 306 aa  331  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  58.88 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  58.88 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  57.98 
 
 		 307 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  59.21 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  55.81 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  60.47 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  57.95 
 
 		 310 aa  312  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  55.52 
 
 		 343 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  55.48 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  54.82 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  55.81 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  55.48 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  56.25 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  55.52 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  51.84 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  59.47 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  55.15 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  53.97 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  48.5 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  46.18 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  50.16 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  45.89 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  50.17 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  50.17 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  45.3 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  48.14 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  34.54 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  32.87 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.78 
 
 		 427 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.08 
 
 		 415 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.59 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.71 
 
 		 426 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.42 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 415 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  33.98 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  29.3 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  30.08 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  29 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  27.7 
 
 		 415 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.01 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 		 345 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  30.63 
 
 		 360 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  33.65 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  27.54 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  27.01 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  28.96 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  24.14 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  32.96 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.03 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.71 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  27.47 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.69 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.31 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.31 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.56 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  28.2 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  26.37 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.12 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.34 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  35.09 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.02 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.37 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  26.76 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  25.83 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  27.74 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  25.56 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  25.74 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  25.74 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  26.27 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.33 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  26.1 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25.58 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.91 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>