261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3084 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  100 
 
 
261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  51.98 
 
 
257 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  50.23 
 
 
256 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  56.42 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  51.8 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  51.8 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  51.8 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  53.65 
 
 
252 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  46.64 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  40.91 
 
 
299 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  43.83 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  37.66 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  42.19 
 
 
257 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  40.55 
 
 
254 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  41.73 
 
 
268 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.66 
 
 
291 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 
263 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  39.77 
 
 
276 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 
290 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.66 
 
 
291 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  39.64 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  39.29 
 
 
291 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  39.46 
 
 
291 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  39.46 
 
 
291 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  42.35 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  42.35 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  41.57 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  40.46 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  40.39 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  37.84 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  40.84 
 
 
268 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  40.31 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  40.28 
 
 
298 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  40.33 
 
 
268 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  41.29 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  36.14 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39.68 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  89  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.19 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  40.46 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  39.31 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  39.38 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  32.05 
 
 
265 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  39.85 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  39.85 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  40.65 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  41.08 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.11 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  41.1 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  37.74 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  38.55 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  36.17 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  36.93 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  39.1 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  38.91 
 
 
301 aa  79  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.89 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.63 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  36.33 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  35.29 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  41.41 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  39.44 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.97 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  40.78 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  40.49 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  32.31 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  41.4 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  44.02 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  41.53 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.67 
 
 
306 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.96 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  33.15 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  39.43 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.09 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  31.95 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  35.17 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  39.89 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  36.97 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  37.86 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.01 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  39.59 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  37.81 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  37.61 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.37 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.55 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>