288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11828 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  504  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  74.14 
 
 
267 aa  345  5e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  52.45 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  54.92 
 
 
277 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  52.94 
 
 
268 aa  250  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  51.69 
 
 
268 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  47.17 
 
 
266 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  47.88 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  41.9 
 
 
291 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  41.9 
 
 
291 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  41.9 
 
 
291 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  42.35 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  42.35 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  41.11 
 
 
291 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
257 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  39.39 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  38.82 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.62 
 
 
299 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  37.7 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
302 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.79 
 
 
301 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  37.19 
 
 
256 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.45 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  35.38 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  39.85 
 
 
254 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  40.32 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.21 
 
 
266 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  40.15 
 
 
252 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  36.21 
 
 
292 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  34.31 
 
 
252 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  35.27 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.08 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.68 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  29.89 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  26.85 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  34.6 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  30.04 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  26.39 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.78 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  28.62 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  27.69 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.74 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.8 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  31.66 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.2 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  26.57 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  30.04 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.95 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.95 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.25 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  26.01 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.42 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  27.69 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  27.69 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  29.77 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.63 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  29.3 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  28.41 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  30.83 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.25 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  24.23 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.97 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  23.99 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  25.81 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.48 
 
 
306 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  29.27 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  24.91 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  24.91 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  25.19 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  29.06 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  26.74 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>