153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1671 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  98.88 
 
 		 268 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  93.66 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  92.91 
 
 		 268 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  92.54 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  92.54 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  90.67 
 
 		 268 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  86.89 
 
 		 268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  86.72 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  87.11 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  86.67 
 
 		 267 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  70.68 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  48.08 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  48.15 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  47.89 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  41.04 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  46 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  44.74 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  45.49 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  42.16 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  46.56 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  43.77 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  45.63 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  44.88 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  45.85 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  44.36 
 
 		 331 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  46.25 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  46.03 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  38.08 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  43.1 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  40.55 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  39.01 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.7 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.93 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.5 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.1 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  37.36 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.7 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.76 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.11 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  27 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1297  hypothetical protein  73.81 
 
 		 62 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  36.82 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  38.1 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  38.1 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  38.1 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  22.22 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  37.13 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  37.64 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.32 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  23.63 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  29.18 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.71 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  30.19 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.65 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.2 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.19 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  32.48 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.7 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.49 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  27.98 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  37.65 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  27.68 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  35 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25.52 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  26.92 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  29.64 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.92 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  29.45 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.14 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.94 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.93 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.84 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  28.09 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  35.63 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>