170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0108 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  87.73 
 
 		 270 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  72.83 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  73.75 
 
 		 272 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  74.34 
 
 		 272 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  74.02 
 
 		 272 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  56.4 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  56.4 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  56.4 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  51.5 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  56.03 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  45.49 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  55.51 
 
 		 268 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  52.51 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  52.9 
 
 		 331 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  53.23 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  47.97 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  49.06 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  48.21 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  49.39 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  46.64 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  46.64 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  46.64 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  45.49 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  44.32 
 
 		 268 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  44.66 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  44.66 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  44.66 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  44.96 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  44.88 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  44.49 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  43.89 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  42.62 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  39.13 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.24 
 
 		 2798 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.14 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.97 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  32.71 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  32.82 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.39 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30.52 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  28.78 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.46 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.38 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  32.8 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  32.8 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  32.8 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.63 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.01 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.76 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  28.71 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.83 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  36.28 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.39 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  31.62 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25.1 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.39 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  35.81 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.05 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.44 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  34.95 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  34.95 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  34.95 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  36.28 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.77 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  35.33 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  26.96 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.47 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.24 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.4 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  36.02 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.27 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.52 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30.92 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.52 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  37.07 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  34.29 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  34.92 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  25.26 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>