More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3363 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  467  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  51.1 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  49.78 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  51.1 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  51.1 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  51.1 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  55.92 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  45.24 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  45.24 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  45.24 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  44.71 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  44.31 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  44.98 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  40.73 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  44.71 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  43.3 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  46.94 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  43.32 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  39.91 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  41.2 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.56 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  40.23 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  40.38 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  36.32 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  37.65 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  39.75 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  39.83 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  33.6 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  45.53 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  42.41 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  30.2 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  38.7 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  43.37 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  30.61 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  44.07 
 
 		 292 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  41.75 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.71 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  40.18 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  36.61 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  29.75 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  41.24 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  39.25 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  36.98 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  38.16 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  35.93 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.63 
 
 		 2798 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.28 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  37.69 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  35.34 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  34.96 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  36.24 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.55 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  35.06 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  33.92 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.8 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  35.57 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.55 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  35.47 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  35.78 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  35.04 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  31.3 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  47.34 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  36.02 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  36.55 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.62 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  43.22 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  35.68 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  36.68 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  31.52 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  32.94 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  42.37 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  38.78 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  37.8 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  42.61 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  38.62 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.79 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  34.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.3 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.79 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  36.98 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>