More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4144 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
260 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  96.92 
 
 
260 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  65.89 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  62.55 
 
 
259 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  63.14 
 
 
260 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  58.5 
 
 
286 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  56.52 
 
 
271 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  54.51 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  57.45 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  56.09 
 
 
267 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  54.07 
 
 
267 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  58.33 
 
 
272 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  57.45 
 
 
262 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  59.76 
 
 
262 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  54.15 
 
 
267 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  53.97 
 
 
261 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  53.11 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  53.52 
 
 
257 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  52.9 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  50.79 
 
 
261 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  58.26 
 
 
269 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  58.65 
 
 
259 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  50.79 
 
 
261 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  57.71 
 
 
268 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  56.39 
 
 
268 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  53.39 
 
 
268 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  54.98 
 
 
261 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  42.22 
 
 
293 aa  148  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  48.68 
 
 
253 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  43.94 
 
 
276 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  45.32 
 
 
288 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  48.04 
 
 
256 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  48.04 
 
 
256 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  44.78 
 
 
255 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
291 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  42.99 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  37.16 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  42.99 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  42.99 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  55.83 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.34 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.93 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  43.81 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.68 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.21 
 
 
299 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.84 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  35.57 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.14 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  41.15 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  30.93 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.61 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  38.83 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30 
 
 
2798 aa  76.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.15 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  34.48 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26.84 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.5 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  31.95 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.27 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.2 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.27 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38.71 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.18 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.8 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.55 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  32.47 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.55 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.19 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.62 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.57 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.8 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  38.13 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  32.13 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  32.26 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  29.71 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.39 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  22.89 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.29 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.29 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30.92 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  32.6 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32.6 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.05 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  32.6 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>