298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2471 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  53.91 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  53.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  53.91 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  50 
 
 
259 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  51.18 
 
 
260 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  49.13 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  48.43 
 
 
267 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  51.2 
 
 
272 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  53.52 
 
 
260 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  50.43 
 
 
267 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  55.86 
 
 
261 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  50.4 
 
 
262 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  52.19 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  48.05 
 
 
261 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  45.78 
 
 
260 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  47.81 
 
 
267 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  45.78 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  45.78 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  55.22 
 
 
269 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  48.63 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  51.87 
 
 
259 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  53.74 
 
 
268 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  50 
 
 
262 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  48.48 
 
 
261 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  53.74 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  55 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  37.8 
 
 
276 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  36.7 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  46.74 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  36.64 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.48 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.94 
 
 
299 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  41.03 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  33.91 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  33.04 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  37.64 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36.87 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  32.44 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  35.33 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  37.59 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  35.06 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.2 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  35.53 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.16 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  41.86 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  35.91 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.78 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.91 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  30.24 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  44.35 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  32.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  30.89 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  31.43 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  33 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  33.59 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.97 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  29.41 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  32.23 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  46.22 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.74 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.27 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  29.91 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.32 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  31.85 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.89 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  37.56 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.28 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.45 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.89 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  24.41 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  29.17 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  29.91 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.6 
 
 
304 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.11 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  25.58 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.96 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  25.58 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.2 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  33.67 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  27.36 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.06 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  34.27 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.44 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
302 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>