179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1472 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  91.57 
 
 
261 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  91.16 
 
 
261 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  90.76 
 
 
249 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  75.1 
 
 
249 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  73.81 
 
 
254 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  70.56 
 
 
248 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  71.19 
 
 
243 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  63.13 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  66.51 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  66.03 
 
 
249 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  45.53 
 
 
254 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  46.08 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  44.88 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  44.39 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  43.64 
 
 
254 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  47.25 
 
 
255 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  41.41 
 
 
263 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  42.01 
 
 
260 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  42.01 
 
 
260 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  40.54 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  42.13 
 
 
244 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.06 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.19 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.8 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.72 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  29.84 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.28 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.28 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.03 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.41 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  27.43 
 
 
123 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.03 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.15 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  22.73 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  28.57 
 
 
117 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  30.25 
 
 
121 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.64 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.75 
 
 
2798 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  26.1 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  24.45 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  31.93 
 
 
121 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  38.24 
 
 
123 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  28.09 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  39.05 
 
 
120 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.09 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  25.71 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  22.96 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  22.5 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.95 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  26.94 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  21.89 
 
 
266 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  23.79 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  22.51 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  28.68 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  23.95 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  24.22 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  26.94 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  20.62 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  27.95 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  26.79 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  22.18 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  25.86 
 
 
120 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  37.96 
 
 
119 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 
307 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  39.47 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  25.09 
 
 
296 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.37 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  21.99 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  24.55 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  27.24 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  23.98 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  29.82 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  29 
 
 
126 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  24.58 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  23.75 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  22.47 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  22.91 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  23.87 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  22.78 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  19.19 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  22.78 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  22.28 
 
 
252 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  39.18 
 
 
125 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>