More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0364 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  88.93 
 
 		 267 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  84.35 
 
 		 267 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  61.21 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  63.09 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  62.66 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  56.22 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  56.45 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  62.34 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  54.07 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  61.84 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  52.99 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  52.21 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  53.25 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  48.47 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  50.87 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  57.87 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  51.81 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  49.13 
 
 		 257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  46.15 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  49.14 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  45.06 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  54.88 
 
 		 261 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  47.51 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  50.39 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  46.78 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  39.39 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  47.31 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  39.47 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  44.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.33 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.62 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  43.07 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  41.44 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.48 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.45 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.87 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.87 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  37.02 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.46 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.89 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.74 
 
 		 2798 aa  82.8  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  37.05 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  36.47 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.34 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  33.76 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.75 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.34 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.38 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  32.04 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  35.09 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.2 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.07 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  31.44 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.44 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  32.67 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  37.21 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.23 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  39.06 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  35.16 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  29.64 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.11 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.23 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.23 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  26.74 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  29.91 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31.87 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  30.54 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  28.63 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  31.15 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.43 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  32.22 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.75 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  45.83 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  30.73 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>