More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6796 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  67.58 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  61.04 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  64.84 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  60.94 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  58.5 
 
 		 260 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  57.32 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  57.87 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  56.2 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  55.07 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  56.91 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  57.53 
 
 		 260 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  62.02 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  60.63 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  58.47 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  62.5 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  56.14 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  62.98 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  50.4 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  52.86 
 
 		 257 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  57.14 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  57.14 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  44.94 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  56.36 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  56.78 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  49.8 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  49.8 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  51.35 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  38.04 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  49.8 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.3 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  42.75 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  44.02 
 
 		 256 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.02 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  36.4 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42.72 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  38.16 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.53 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.28 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.16 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  39.37 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  37.93 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  34.4 
 
 		 254 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  53.52 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.45 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.2 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.44 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  35.6 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  35.85 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.16 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  32.84 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.41 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  29.71 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  30.42 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  40.43 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  36.09 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  36.09 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  36.09 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.72 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.73 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.93 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  37.41 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.47 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  34.35 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  32.61 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.58 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.03 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.41 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.09 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.31 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32.32 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.01 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  33.62 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  31.07 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.51 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  35.21 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.15 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.08 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  33.46 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  38.01 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  29.05 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>