More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3050 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  65.5 
 
 
260 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  65.89 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  59.74 
 
 
259 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  61.13 
 
 
260 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  60.63 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  52.33 
 
 
260 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  54.94 
 
 
271 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  56.71 
 
 
262 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  56.92 
 
 
262 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  55.29 
 
 
262 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  55.93 
 
 
261 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  55.51 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  53.54 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  50.43 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  52.19 
 
 
257 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  49.42 
 
 
261 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  49.42 
 
 
261 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  51.18 
 
 
272 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  49.8 
 
 
267 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  49.61 
 
 
267 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  44.4 
 
 
276 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  54.74 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  54.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  41.91 
 
 
293 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  56.37 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  51.93 
 
 
268 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  41.64 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  52.42 
 
 
268 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  51.54 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  46.01 
 
 
288 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  44.69 
 
 
253 aa  131  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  47.78 
 
 
256 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  47.78 
 
 
256 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  45.27 
 
 
255 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 
291 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  38.19 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  38.19 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  38.19 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.48 
 
 
301 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  36.8 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.36 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.9 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  51.03 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  39.23 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  31.11 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  30.74 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.76 
 
 
254 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  32.93 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  34.1 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.88 
 
 
2798 aa  85.5  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.73 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  38 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.54 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.89 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.01 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.91 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  34.02 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  35.77 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.46 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  35.98 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.2 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.74 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.05 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.88 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.05 
 
 
307 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  35.19 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  38.2 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  26.98 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  31.67 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  32.07 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  31.27 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  35.26 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  33.76 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.51 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.64 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.73 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.97 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.31 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.45 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  30.92 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.25 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.38 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>