172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4018 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 260 aa  500  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 260 aa  500  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  77.33 
 
 		 263 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  58.91 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  59.91 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  55.96 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  55.96 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  52.23 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  54.02 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  44.49 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  44.53 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  42.27 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  44.94 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  44.94 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  40.36 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  45.19 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  41.59 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  45.61 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  40.62 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  41.07 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  36.49 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.23 
 
 		 2798 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.24 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25.22 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.04 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  22.85 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  33.62 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  32.46 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.57 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  27.4 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  29.92 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  23.81 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.84 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  26.55 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.44 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.32 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  28.7 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.41 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.82 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.08 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  27.55 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  28.77 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.64 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  21.4 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.78 
 
 		 121 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.03 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  26.42 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  24.42 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  21.76 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  26.26 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.05 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  25.24 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  25.56 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  27.16 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  25.7 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  28.82 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  25.7 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  38.74 
 
 		 120 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  22.61 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.2 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  30.25 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  31.13 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  29.73 
 
 		 117 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  25.69 
 
 		 123 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  23 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  29.44 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  21.48 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  25.23 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.91 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  25.52 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  33.06 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  20.18 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  22.45 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  23.58 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  25.47 
 
 		 108 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  29.5 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  21.52 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  45.9 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  22.27 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>