187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0462 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  234  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  75.21 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  72.73 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  75 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  63.64 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  69.64 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  48.36 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  42.06 
 
 		 2798 aa  82.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  51.43 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  47.93 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  46.81 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  42.45 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  43.02 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  41.03 
 
 		 260 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  41.03 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  36.52 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  38.94 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  53.4 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  35.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  35.96 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35.59 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  37.86 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  35.59 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  36.84 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  34.48 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 		 286 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  31.53 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  31.09 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  34.21 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.3 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  36.72 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  37.7 
 
 		 260 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  45.05 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  35.92 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.75 
 
 		 267 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  32.79 
 
 		 268 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 		 258 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  28.46 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.16 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  37.76 
 
 		 293 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.95 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.95 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.95 
 
 		 291 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  34.65 
 
 		 260 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  34.65 
 
 		 260 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 		 268 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  34.48 
 
 		 257 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  38.32 
 
 		 257 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.04 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  35.9 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  35.9 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  33.04 
 
 		 266 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  33.68 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  34.51 
 
 		 261 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.67 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  34.51 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.29 
 
 		 306 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  32.26 
 
 		 330 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  34.51 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.79 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 268 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  34.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  34.51 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 		 305 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  29.2 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32.74 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  34.65 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.19 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  33.62 
 
 		 270 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.7 
 
 		 306 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  34 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  41.3 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  32.41 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  31.67 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  34 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  34 
 
 		 266 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>