179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6948 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  222  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  53.39 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  49.17 
 
 
121 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  48.74 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  49.15 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  42.5 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  53.51 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  49.17 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  47.06 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  49.14 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  40.35 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  40.71 
 
 
251 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  46.09 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  46.72 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  42.37 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  36.21 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  38.94 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  44.34 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  41.59 
 
 
254 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  34.55 
 
 
2798 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  39.64 
 
 
255 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  38 
 
 
286 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  39.64 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  36 
 
 
269 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  38.14 
 
 
260 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  37.82 
 
 
260 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  37.7 
 
 
260 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  37.82 
 
 
260 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  47.76 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  32.73 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  38.52 
 
 
260 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  38.83 
 
 
260 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  39.09 
 
 
249 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  38.83 
 
 
260 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
285 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  51.67 
 
 
258 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  38.52 
 
 
267 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  37.27 
 
 
249 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  52.54 
 
 
263 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  37.27 
 
 
261 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  37.27 
 
 
261 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  38.39 
 
 
250 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  34.95 
 
 
254 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  31.58 
 
 
262 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  34.4 
 
 
264 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  39.67 
 
 
260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  34.4 
 
 
268 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.25 
 
 
263 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  38.05 
 
 
275 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  32.67 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  35.87 
 
 
296 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  46.43 
 
 
269 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  35.87 
 
 
305 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  35.04 
 
 
294 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  34.23 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  38.64 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  36.04 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
325 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  41.51 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.48 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  33.85 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  35.64 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  36.21 
 
 
277 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
266 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  33.93 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.5 
 
 
270 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  34.74 
 
 
293 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  39.82 
 
 
249 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  34.82 
 
 
267 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 
277 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  32.54 
 
 
272 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  29.13 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  35.34 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  34.51 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  37 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  38.94 
 
 
249 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  33.86 
 
 
298 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  39.05 
 
 
257 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  37.84 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.93 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 
280 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  51.85 
 
 
277 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  34.31 
 
 
267 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 
300 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  36.28 
 
 
255 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  31.36 
 
 
282 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  35.14 
 
 
263 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.81 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.48 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>