160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1785 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  225  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  67.77 
 
 
121 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  66.12 
 
 
121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  73.55 
 
 
121 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  69.64 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  67.24 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  49.55 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  42.11 
 
 
2798 aa  77  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  59.42 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  42.34 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  39.5 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  39.32 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  34.19 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  38.84 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  49.3 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  45.26 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  39.68 
 
 
260 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  44.54 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  39.53 
 
 
260 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  38.28 
 
 
260 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  38.93 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  39.32 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  37.98 
 
 
260 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  37.98 
 
 
260 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  39.06 
 
 
267 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  44.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  37.29 
 
 
265 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  38.68 
 
 
244 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  38.84 
 
 
258 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  37.29 
 
 
269 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  37.93 
 
 
260 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  33.33 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  30.63 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  54.13 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  38.79 
 
 
268 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  36 
 
 
268 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  37.84 
 
 
254 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  39.42 
 
 
249 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  39.42 
 
 
261 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  39.42 
 
 
261 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  37.38 
 
 
261 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  38.79 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  34.38 
 
 
265 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  38.24 
 
 
302 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.84 
 
 
264 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.84 
 
 
268 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  44.87 
 
 
260 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.01 
 
 
270 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43654  predicted protein  43.9 
 
 
629 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.769463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 
285 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  34.31 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  32.14 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
286 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  32.76 
 
 
265 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.4 
 
 
270 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  39.81 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  31.54 
 
 
270 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  42.86 
 
 
277 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
270 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  35.71 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  33.94 
 
 
255 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  32.46 
 
 
286 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
270 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  36.04 
 
 
254 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  34.17 
 
 
294 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  28.81 
 
 
270 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5038  hypothetical protein  43.12 
 
 
132 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.337261  normal  0.113634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
267 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  35.51 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  37.96 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  37.29 
 
 
298 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  30.17 
 
 
257 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.19 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1447  hypothetical protein  37.72 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.73 
 
 
259 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  35.29 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  41.67 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 
303 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  29.31 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  29.31 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.52 
 
 
266 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  36.11 
 
 
267 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  35.9 
 
 
300 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  36.11 
 
 
268 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  38.14 
 
 
272 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  37.61 
 
 
273 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  31.46 
 
 
662 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  36.11 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  37.61 
 
 
274 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  29.25 
 
 
266 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  28.85 
 
 
243 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  32.46 
 
 
282 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  35.92 
 
 
263 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.31 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  29.31 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.23 
 
 
270 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>