173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2026 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
270 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  98.15 
 
 
270 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  84.76 
 
 
270 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  33.21 
 
 
275 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  32.55 
 
 
294 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  33.99 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  29.63 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  31.15 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  30.33 
 
 
277 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.11 
 
 
272 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  29.49 
 
 
277 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.54 
 
 
260 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.54 
 
 
260 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.92 
 
 
260 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  32.55 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  28.76 
 
 
274 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  31.33 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.38 
 
 
267 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  33.77 
 
 
264 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.88 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  32.08 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.15 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  32.83 
 
 
267 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  30.21 
 
 
274 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 
265 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  28.21 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.66 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  30.67 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  30.89 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 
263 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  31.9 
 
 
268 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.6 
 
 
265 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  31.78 
 
 
276 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  31.44 
 
 
264 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.63 
 
 
268 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  32.28 
 
 
266 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  29.06 
 
 
265 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  30.22 
 
 
278 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 
272 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 
265 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  32.28 
 
 
266 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.31 
 
 
273 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.31 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  29.74 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.57 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  27.78 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  31.48 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  25.96 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  28.76 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.1 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
261 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.35 
 
 
265 aa  92  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
268 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  27.35 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1485  hypothetical protein  29.55 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.156488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  31.2 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1422  hypothetical membrane spanning protein  29.17 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  27.84 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  31.78 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.48 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  28.96 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  28.27 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  25.57 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  27.59 
 
 
260 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.96 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  29.07 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  28.45 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  25.1 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  27.57 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  27.9 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  30.42 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4249  hypothetical protein  28.97 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  28.11 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  29.82 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  28.46 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  29.55 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  26.01 
 
 
282 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  28.09 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  28.19 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  26.44 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  25.85 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  26.05 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>