185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1707 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  98.15 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  84.76 
 
 		 270 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  31.37 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  33.6 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  29.26 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.11 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  30.74 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  29.18 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  29.92 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  29.06 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  31.76 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.89 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.62 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.38 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  30.6 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.38 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  32.28 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  31.32 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  29.96 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.23 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.23 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  32.71 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  32.28 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.8 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.85 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  32.08 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.28 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.98 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  29.83 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.68 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  31.5 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  32.68 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.04 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  30.74 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  30.3 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  29.48 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.48 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  31.58 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  26.38 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  29.18 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.69 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  27.78 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  28.88 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  26.92 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  30.37 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  27.03 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.71 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  28.27 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1485  hypothetical protein  29.55 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.156488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1422  hypothetical membrane spanning protein  29.17 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  31.12 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  27.06 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.81 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  26.38 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  30.48 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  27.9 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  29.07 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  26.82 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  24.68 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  25.58 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  27.57 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  28.02 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  30.28 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  29.28 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  28 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  26.82 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  26.81 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4249  hypothetical protein  28.74 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  28.57 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  26.62 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  29.55 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.9 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  27.31 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  23.91 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>