221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1033 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  70.59 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  52.89 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  47.93 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  52.07 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  51.3 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  49.15 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  58.26 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  45.54 
 
 		 2798 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  43.1 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  45.05 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  52.07 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  46.02 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  45.13 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  40.87 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  39.2 
 
 		 260 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  39.2 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  34.4 
 
 		 260 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  41.07 
 
 		 286 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  39.81 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  38.39 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  42.22 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  39.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  39.29 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  41.67 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  34.68 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  33.06 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  33.06 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  37.7 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  32.76 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  34.43 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  34.78 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  36.67 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  45 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.48 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  37.04 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  36.11 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  34.75 
 
 		 302 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  36.11 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  36.11 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  33.93 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.24 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  36.04 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  41.88 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  36.94 
 
 		 263 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  33.91 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  32.71 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  38.39 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  35.48 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 		 265 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.23 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 260 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  35.78 
 
 		 283 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 260 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  38.6 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  39.45 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  33.9 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  38.05 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  38.6 
 
 		 268 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  41.77 
 
 		 260 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  37.72 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  32.76 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  39.62 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  32.73 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  32.26 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  31.71 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  34.19 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  32.71 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  34.71 
 
 		 262 aa  48.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  35.9 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.73 
 
 		 257 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  36.21 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  37.97 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  31.48 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  36.54 
 
 		 267 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  30.4 
 
 		 268 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.46 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 		 267 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  36.73 
 
 		 265 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.77 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  32.43 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  34.78 
 
 		 242 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  35.04 
 
 		 263 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  40.79 
 
 		 277 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  34.71 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>