111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2884 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  100 
 
 
120 aa  228  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2539  hypothetical protein  41.11 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  43.02 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  37.23 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1446  hypothetical protein  41.57 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
258 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  34.55 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  38 
 
 
251 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  38.18 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  39.36 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.97 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  34.78 
 
 
260 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.07 
 
 
2798 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  33.66 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  33.94 
 
 
254 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  37 
 
 
255 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.94 
 
 
277 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  39.32 
 
 
120 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  35.92 
 
 
263 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 
286 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  36.08 
 
 
300 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.06 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 
254 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 
254 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
268 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  30.69 
 
 
267 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 
302 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  31.63 
 
 
271 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  34.38 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  34.02 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  31.18 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  29.89 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29550  predicted protein  32.43 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392042  normal  0.0763581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  31.53 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
258 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  32.67 
 
 
309 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  32.32 
 
 
254 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  30.56 
 
 
302 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  32.04 
 
 
245 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  28.69 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.06 
 
 
260 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  29.17 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  30.12 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.22 
 
 
662 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  30.09 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2766  membrane protein  32.18 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.094222  decreased coverage  0.00946421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  26.13 
 
 
301 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.84 
 
 
257 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  29.6 
 
 
274 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  29.73 
 
 
266 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  33.66 
 
 
291 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  33.66 
 
 
291 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  31.37 
 
 
261 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  31.37 
 
 
261 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  34.83 
 
 
261 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  31.53 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  42.59 
 
 
325 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
278 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5038  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.337261  normal  0.113634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  32.43 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  32.43 
 
 
263 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  42.59 
 
 
239 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  42.59 
 
 
324 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.93 
 
 
266 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  32.97 
 
 
262 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  25.22 
 
 
266 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  30.65 
 
 
298 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  31.37 
 
 
261 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.7 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  32.38 
 
 
267 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>