38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0369 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 262 aa  490  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  69.73 
 
 		 276 aa  328  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  66.41 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  66.81 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  67.66 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  68.38 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  65.96 
 
 		 261 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  57.25 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  43.04 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  71.93 
 
 		 662 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  61.61 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  46.39 
 
 		 108 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.54 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.72 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  29.73 
 
 		 123 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.17 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.17 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.59 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.29 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  28.88 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.35 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.16 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.8 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.57 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.66 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.32 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.71 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  29.2 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  29.57 
 
 		 121 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  37.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 		 261 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>