32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0873 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  72.48 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  68.57 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  66.38 
 
 		 276 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  72.73 
 
 		 261 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  66.81 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  68.51 
 
 		 262 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  59.53 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  48.03 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  45.68 
 
 		 267 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  45.68 
 
 		 267 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  75.18 
 
 		 211 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  64.83 
 
 		 662 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  37.59 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  45.26 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.53 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.31 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  31.19 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  32.12 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.52 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  32.12 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.7 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  33.75 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.26 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  38.14 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  31.62 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>