101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2539 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  231  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  69.67 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  41.23 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1446  hypothetical protein  56.03 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  36.36 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.03 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  32.67 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.59 
 
 		 2798 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  32.71 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  32.74 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  34.55 
 
 		 251 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  30.48 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  36.7 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  45.76 
 
 		 258 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  29.47 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  35.14 
 
 		 255 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 		 286 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  26.79 
 
 		 301 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  34.78 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  40.52 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  34.13 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  31.48 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  36.14 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 		 267 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  32 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  27.36 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  33.09 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  35.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 277 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  30.1 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.68 
 
 		 269 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  36.49 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  29.47 
 
 		 249 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  30.51 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  29.41 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  29.41 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  28.85 
 
 		 261 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  35.14 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.48 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  29.69 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  29.69 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2766  membrane protein  35.29 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.094222  decreased coverage  0.00946421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  29.92 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 		 258 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  30.23 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  29.82 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  28 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.58 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  31.53 
 
 		 266 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  29.27 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  32.52 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  26.55 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  31.03 
 
 		 272 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  30.61 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.88 
 
 		 298 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  30.3 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.85 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.85 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.85 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  32.46 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.85 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.36 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.68 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  31.63 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  26.85 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.85 
 
 		 266 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  24.44 
 
 		 277 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2333  hypothetical protein  30.12 
 
 		 288 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.248827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  31.87 
 
 		 249 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.85 
 
 		 266 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  24.3 
 
 		 307 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  27.2 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  31.16 
 
 		 273 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  34.75 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.62 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  28.23 
 
 		 247 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  24.18 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  40  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>