264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0357 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  66.14 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  48.33 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  44.25 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  42.24 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  37.84 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  39.6 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  41.07 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  41.57 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  36.54 
 
 		 2798 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  37.07 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  37.39 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  41.12 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  39.82 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  39.6 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.65 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  41.05 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  37.84 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  43.36 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  39.39 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.88 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  36.36 
 
 		 269 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  36.22 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  37.38 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  36.94 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.95 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  34.55 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.83 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  39.29 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.96 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  33.63 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  36.8 
 
 		 273 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  32.79 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  34.35 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.83 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  34.82 
 
 		 302 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  34.23 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  32.03 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  35.14 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.71 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  34.58 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  30.7 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  35.9 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  30.97 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  34.17 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  35.51 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  33.04 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  33.06 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  33.9 
 
 		 266 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  30.63 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  38 
 
 		 245 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  34.65 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  32.65 
 
 		 255 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  28.46 
 
 		 257 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  31.5 
 
 		 270 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 300 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  32.35 
 
 		 302 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.54 
 
 		 272 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  34.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5037  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  0.114228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.48 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  33.98 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  32.67 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4500  hypothetical protein  29.27 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000116291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  39.33 
 
 		 286 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  35.45 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  33.96 
 
 		 415 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  35.45 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0744  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0692  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00620748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1447  hypothetical protein  35.51 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0678  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2539  hypothetical protein  31.11 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0781  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0944  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000183675  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  29.46 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30.71 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>